Məhərrəm Məmmədov ordudan tərxis olunduqdan sonra 1981-1982-ci illərdə Azərbaycan Sənaye Tikinti Nazirliyinin 8 saylı trestinin 86 saylı tikinti idarəsində fəhlə işləmişdir. 1982-ci ildə isə N.Nərimanov adına Azərbaycan Dövlət Tibb İnstitutunun müalicə-profilaktika fakültəsinə daxil olmuşdur. 1988-ci ildə institutu bitirərək doğma Borçalıya qayıtmış, Bolnisi rayon xəstəxanasında həkim-intern işləmişdir.
Məhərrəm Məmmədov 1989-cu ildən Zaqatala rayonunun Yengiyan kənd ambulatoriyasının baş həkimi kimi fəaliyyət göstərmişdir. 1993-1995-ci illərdə isə Azərbaycan Milli Ordusunda xidmət etmiş, Füzuli bölgəsində torpaqlarımızın azad olunmasında iştirak etmişdir. 1995-ci ildə ordudan tərxis olunduqdan sonra yenidən Zaqatala rayonunda çalışmışdır.
1996-cı ildən isə fəaliyyətini Bakının Pirallahı (Artyom) qəsəbəsindəki 3 saylı tibbi sanitar hissədə həkim-kardioloq kimi davam etdirir.